Két élőhely határa nem feltétlenül válik el élesen. Sok erdei élőhely peremvidéke fokozatosan megy át valamelyik nyílt élőhelybe, például a füves pusztába. Máskor viszont teljesen egyértelmű a határvonal. A barlangi élőhelyek határát például a geológiai tényezők rendszerint pontosan kijelölik: az ott honos élővilág jellegét rendszerint megszabja a fény és táplálék szűkössége. A barlang bejáratánál a körülmények gyakran egészen mások, mint beljebb, az üregrendszer mélyén. Hasonlóképpen a mélytengeri hidrotermális kürtőkhöz kapcsolódó, nemrég felfedezett élőhelyek is csak a tengerek bizonyos, jól körülhatárolt területein fordulnak elő.